有些特异患者,其肿瘤侵犯卵圆孔后,可进入海绵窦而引起单侧上睑下垂,和瞳孔光反应消失症状。一些病理中还存在复视、斜视或眼肌麻痹,角膜反射消失,前额或面中部感觉异常麻痹,以及咀嚼肌萎缩等情况发生。

对脑神经侵犯所引起的症状和体征,称为岩蝶综合征。当肿瘤侵犯颞骨的岩部和蝶骨进入海绵窦时,因为第VI支脑神经在海绵窦的内下部,因此第VI支脑神经常首先受到侵犯。由于鼻咽肿瘤的局部侵犯,或肿大的淋巴结压迫咽侧间隙,可引起声哑或鼻音、味觉改变的病症。
针对咽部括约肌功能不佳的情况,可能会引起吞咽困难、呕吐反射减弱或消失,及软腭上抬不对称、斜方肌和胸锁乳突肌萎缩,以及单侧舌肌萎缩和伸舌时舌偏位的发生。由于颈交感神经受侵,还会出现霍纳综合征等。
由于咽侧间隙受侵而引起的相关症状,称为腮腺后间隙综合征;其第I、W和VID对脑神经即使当肿瘤已发展到晚期,通常仍保持正常功能。诊断评估经过详细的病史问诊和理学检查后,必须进行间接和直接鼻咽镜检查。
诊断上必须仔细观察全部的鼻腔和咽部表面,以估计肿瘤的局部侵犯范围,可以在表面麻醉下,对原发肿瘤直接取活检。如果在鼻咽部看不到原发肿瘤,可以用细针对任何肿大的淋巴结进行针吸,以及对可能侵犯的鼻咽部位进行随机活检。